醫療器械包裝在整個流通過程中占據很重要的作用。如前所說，醫療器械包裝對衛生安全性要求較高，而流通領域的生產、加工、裝卸、運輸、存儲、回收也對衛生安全性產生重要影響。醫療器械生產制造，直到最后消費者手中的整個過程中，包裝要與生產、物流、市場和環境等領域發生相互作用。

如前所述，醫療器械的生產商和消費者相對固定，因此流通的環節相對簡單。醫療器械與市場領域相關的部分主要是銷售量、價格以及獲得的利潤。對于環境領域，則強調產品回收（包括包裝材料的回收處理）等。2006年12月5日，國家食品藥品監督管理局公布《醫療器械召回管理辦法》初稿，向社會征求修改意見，擬將實行醫療器械召回制度。醫療器械召回通常是指按照要求的程序，由醫療器械產品制造商在原地和異地選擇修理、修改、調整、重新標簽、修改說明、銷毀、檢查、替換等方式消除其產品缺陷的過程，而并不是單純地將產品收回的行為。實行召回制度對于制造商來說，將是一個很嚴格的考驗。